Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf239P24399 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms