Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxd8P23463 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxd8P23463 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms