Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SagP20443 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SagP20443 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SagP20443 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SagP20443 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SagP20443 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SagP20443 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SagP20443 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SagP20443 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SagP20443 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SagP20443 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SagP20443 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SagP20443 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SagP20443 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SagP20443 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms