Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VimP20152 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VimP20152 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VimP20152 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VimP20152 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VimP20152 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms