Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn1P18608 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms