Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb1P17919 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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