Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs1P17533 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs1P17533 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms