Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Spi1P17433 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spi1P17433 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Spi1P17433 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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