Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptan1P16546 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sptan1P16546 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sptan1P16546 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sptan1P16546 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptan1P16546 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptan1P16546 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptan1P16546 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptan1P16546 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptan1P16546 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptan1P16546 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sptan1P16546 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sptan1P16546 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sptan1P16546 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sptan1P16546 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sptan1P16546 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms