Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-D1P14427 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms