Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Vpreb1P13372 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vpreb1P13372 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms