Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctla2aP12399 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctla2aP12399 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms