Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PolP11369 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PolP11369 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PolP11369 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PolP11369 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PolP11369 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolP11369 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolP11369 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms