Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Igsf6P0C6B7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Igsf6P0C6B7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms