Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxb5P09079 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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