Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxb6P09023 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb6P09023 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms