Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TtrP07309 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TtrP07309 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TtrP07309 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtrP07309 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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TtrP07309 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtrP07309 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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TtrP07309 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TtrP07309 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtrP07309 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TtrP07309 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TtrP07309 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtrP07309 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtrP07309 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TtrP07309 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtrP07309 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TtrP07309 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtrP07309 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtrP07309 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtrP07309 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtrP07309 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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