Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxa4P06798 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa4P06798 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms