Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apoa4P06728 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms