Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04224 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04224 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04224 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04224 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms