Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tgfb1P04202 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb1P04202 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms