Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-AaP01910 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms