Protein–RNA interactions for Protein: P01904

H2-Ea, H-2 class II histocompatibility antigen, E-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-EaP01904 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-EaP01904 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms