Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01662 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01662 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01662 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01662 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01662 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01662 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms