Protein–RNA interactions for Protein: P01139

Ngf, Beta-nerve growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfP01139 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfP01139 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfP01139 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NgfP01139 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NgfP01139 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NgfP01139 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NgfP01139 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NgfP01139 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NgfP01139 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NgfP01139 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NgfP01139 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfP01139 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfP01139 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfP01139 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfP01139 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfP01139 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfP01139 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfP01139 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfP01139 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NgfP01139 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms