Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnkO88874 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnkO88874 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CcnkO88874 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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