Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc28a2O88627 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms