Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme6O88425 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme6O88425 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms