Protein–RNA interactions for Protein: O88245

Gm10139, Mszf85 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10139O88245 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm10139O88245 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm10139O88245 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm10139O88245 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm10139O88245 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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