Protein–RNA interactions for Protein: O70481

Ubr1, E3 ubiquitin-protein ligase UBR1, mousemouse

Predictions only

Length 1,757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr1O70481 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr1O70481 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr1O70481 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubr1O70481 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms