Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chrna4O70174 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrna4O70174 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrna4O70174 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chrna4O70174 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms