Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alx3O70137 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Alx3O70137 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms