Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema6bO54951 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms