Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DffbO54788 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DffbO54788 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DffbO54788 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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DffbO54788 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
DffbO54788 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DffbO54788 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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