Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcns1O35173 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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