Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Kcnk3O35111 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnk3O35111 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnk3O35111 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Kcnk3O35111 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Kcnk3O35111 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms