Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnih2O35089 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms