Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn4O35054 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cldn4O35054 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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