Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Casq1O09165 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms