Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17078M0QW51 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms