Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm15938-201ENSMUST00000150079 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Gm21887J3QQ04 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms