Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gm19965J3QNY8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gm19965J3QNY8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm19965J3QNY8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm19965J3QNY8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm19965J3QNY8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm19965J3QNY8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm19965J3QNY8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm19965J3QNY8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm19965J3QNY8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm19965J3QNY8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Gm19965J3QNY8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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