Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3336J3QMQ6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3336J3QMQ6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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