Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3727J3QM54 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3727J3QM54 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3727J3QM54 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3727J3QM54 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3727J3QM54 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3727J3QM54 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm3727J3QM54 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm3727J3QM54 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3727J3QM54 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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