Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp994J3QM38 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms