Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms