Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm29394H3BIW7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm29394H3BIW7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms