Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r34G3XA52 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms