Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hmgxb3G3X9M3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms