Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Farp1F8VPU2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms